據臺灣方面陸委會網站，1987年臺灣當局開放民眾到大陸探親，兩岸民間往來日趨密切，臺灣“行政院”于1988年8月，以“任務編組”的方式成立“行政院大陸工作會報”，協調當局相關部門處理有關大陸的事務。1990年4月，臺灣當局為了強化大陸政策的決策功能及工作推動效率，特別擬定“行政院大陸委員會組織條例（草案）”，經臺灣立法機構1991年1月18日通過，同月28日公布施行。至此，臺灣陸委會正式成為臺灣當局統籌處理大陸事務的專責機構。